El Consejo Universitario es la autoridad colegiada para la dirección ejecutiva, académica y administrativa de la Universidad. Lo integra el Rector, quien lo preside; el Vicerrector Académico; el Vicerrector Administrativo; el Vicerrector de Postgrado, Investigación y Extensión; el Secretario; el Decano de Desarrollo Pastoral, Social y Estudiantil;  los Decanos de las Facultades; un (1) representante de los profesores; un (1) representante estudiantil; un (1) representante de los egresados y un (1) representante de los trabajadores, profesionales, administrativos y obreros.